MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	A	6	6	18	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013167	ATGA	2	8	48	55	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013167	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013167	TTA	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013167	TTA	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013167	GTT	4	12	166	177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013167	GATG	2	8	204	211	25 %	25 %	50 %	0 %	256823862
8	NC_013167	TAA	3	9	214	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823862
9	NC_013167	T	6	6	228	233	0 %	100 %	0 %	0 %	256823862
10	NC_013167	AACT	2	8	267	274	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
11	NC_013167	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
12	NC_013167	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823862
13	NC_013167	GAC	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823862
14	NC_013167	AATATC	2	12	367	378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256823862
15	NC_013167	TCT	2	6	395	400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823862
16	NC_013167	ATT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
17	NC_013167	T	6	6	510	515	0 %	100 %	0 %	0 %	256823862
18	NC_013167	TAAC	2	8	528	535	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
19	NC_013167	TAA	2	6	553	558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013167	CTAATT	2	12	568	579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256823863
21	NC_013167	TTC	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823863
22	NC_013167	AGATT	2	10	654	663	40 %	40 %	20 %	0 %	256823863
23	NC_013167	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823863
24	NC_013167	AGTT	2	8	707	714	25 %	50 %	25 %	0 %	256823863
25	NC_013167	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
26	NC_013167	ATCT	2	8	847	854	25 %	50 %	0 %	25 %	256823863
27	NC_013167	TCC	2	6	865	870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
28	NC_013167	AAT	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013167	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013167	T	6	6	959	964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013167	TCA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013167	AAC	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013167	TAA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013167	TAA	2	6	1128	1133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013167	TAA	2	6	1135	1140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013167	TAA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013167	TAA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013167	TAA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013167	TAA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013167	ATA	2	6	1169	1174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013167	TTCA	2	8	1212	1219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013167	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013167	T	6	6	1239	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013167	TTA	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013167	TTA	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013167	TTA	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013167	A	6	6	1382	1387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013167	AT	3	6	1428	1433	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
49	NC_013167	GA	3	6	1456	1461	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
50	NC_013167	ATCCA	2	10	1510	1519	40 %	20 %	0 %	40 %	256823864
51	NC_013167	ACC	3	9	1559	1567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
52	NC_013167	GTA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
53	NC_013167	CCTT	2	8	1644	1651	0 %	50 %	0 %	50 %	256823864
54	NC_013167	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
55	NC_013167	T	7	7	1732	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
56	NC_013167	GA	3	6	1849	1854	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
57	NC_013167	AGC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
58	NC_013167	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
59	NC_013167	CTG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
60	NC_013167	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823864
61	NC_013167	TAG	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
62	NC_013167	TGT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
63	NC_013167	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
64	NC_013167	ATTA	2	8	2036	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
65	NC_013167	T	6	6	2051	2056	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
66	NC_013167	TTG	3	9	2168	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
67	NC_013167	T	7	7	2192	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
68	NC_013167	TTG	3	9	2213	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
69	NC_013167	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
70	NC_013167	TTAA	2	8	2256	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
71	NC_013167	TTA	2	6	2286	2291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
72	NC_013167	TAT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
73	NC_013167	AAGTA	2	10	2381	2390	60 %	20 %	20 %	0 %	256823864
74	NC_013167	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
75	NC_013167	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
76	NC_013167	CTC	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
77	NC_013167	TTTG	2	8	2520	2527	0 %	75 %	25 %	0 %	256823864
78	NC_013167	T	6	6	2646	2651	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
79	NC_013167	AT	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
80	NC_013167	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
81	NC_013167	GATTA	2	10	2753	2762	40 %	40 %	20 %	0 %	256823864
82	NC_013167	GA	3	6	2764	2769	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
83	NC_013167	TTG	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
84	NC_013167	TGAG	2	8	2808	2815	25 %	25 %	50 %	0 %	256823864
85	NC_013167	TAA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
86	NC_013167	T	7	7	2913	2919	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
87	NC_013167	ATTTA	2	10	2921	2930	40 %	60 %	0 %	0 %	256823864
88	NC_013167	TCT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
89	NC_013167	AATT	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
90	NC_013167	CTC	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
91	NC_013167	GTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
92	NC_013167	AGTTAA	2	12	3014	3025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256823864
93	NC_013167	AAT	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
94	NC_013167	TTA	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
95	NC_013167	CATATT	2	12	3217	3228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256823864
96	NC_013167	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
97	NC_013167	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
98	NC_013167	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
99	NC_013167	GCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
100	NC_013167	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
101	NC_013167	AGA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
102	NC_013167	TTAG	2	8	3495	3502	25 %	50 %	25 %	0 %	256823865
103	NC_013167	TCTTT	2	10	3509	3518	0 %	80 %	0 %	20 %	256823865
104	NC_013167	TGC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823865
105	NC_013167	CT	3	6	3557	3562	0 %	50 %	0 %	50 %	256823865
106	NC_013167	TA	3	6	3738	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013167	TAAG	2	8	3760	3767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013167	CAAT	2	8	3794	3801	50 %	25 %	0 %	25 %	256823866
109	NC_013167	AGG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823866
110	NC_013167	AGC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
111	NC_013167	CGTC	2	8	3845	3852	0 %	25 %	25 %	50 %	256823866
112	NC_013167	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
113	NC_013167	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
114	NC_013167	TGG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823866
115	NC_013167	GAT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
116	NC_013167	GA	3	6	4091	4096	50 %	0 %	50 %	0 %	256823866
117	NC_013167	GAT	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
118	NC_013167	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
119	NC_013167	GAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
120	NC_013167	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
121	NC_013167	TGA	3	9	4200	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
122	NC_013167	GTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
123	NC_013167	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
124	NC_013167	TTG	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
125	NC_013167	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823866
126	NC_013167	CGA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
127	NC_013167	TTC	2	6	4511	4516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
128	NC_013167	CCG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256823866
129	NC_013167	TTC	2	6	4580	4585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
130	NC_013167	GATG	2	8	4594	4601	25 %	25 %	50 %	0 %	256823866
131	NC_013167	T	6	6	4739	4744	0 %	100 %	0 %	0 %	256823866
132	NC_013167	TCT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
133	NC_013167	GTT	2	6	4803	4808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
134	NC_013167	GCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
135	NC_013167	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823866
136	NC_013167	ATC	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
137	NC_013167	CGT	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
138	NC_013167	ATT	2	6	4925	4930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823866
139	NC_013167	T	6	6	4993	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
140	NC_013167	TCT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
141	NC_013167	T	6	6	5073	5078	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
142	NC_013167	CCA	3	9	5166	5174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823867
143	NC_013167	GGT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823867
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146	NC_013167	G	7	7	5464	5470	0 %	0 %	100 %	0 %	256823867
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150	NC_013167	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
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169	NC_013167	GTG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013167	GGC	2	6	6490	6495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_013167	T	6	6	7620	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	256823870
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252	NC_013167	GTT	2	6	9964	9969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_013167	GAT	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_013167	TAA	2	6	10042	10047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013167	TAA	2	6	10049	10054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013167	TAA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013167	ATA	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_013167	A	6	6	10761	10766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_013167	CTT	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823877
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272	NC_013167	TGGA	2	8	11067	11074	25 %	25 %	50 %	0 %	256823877
273	NC_013167	TCT	2	6	11093	11098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823877
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278	NC_013167	TAA	2	6	11479	11484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013167	TAA	2	6	11486	11491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013167	TAA	2	6	11493	11498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013167	TAA	2	6	11507	11512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013167	TAA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_013167	TTA	2	6	11625	11630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_013167	ATA	2	6	15589	15594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_013167	TTA	2	6	15757	15762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_013167	GTT	2	6	15787	15792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823882
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